Pašaltuonyje XVIII a. viduryje įsikūręs benediktinų vienuolynas su bažnyčia, kaip manoma, XVIII-XIX a. sandūroje sudegė. Todėl 1803 m. pastatyta nauja medinė bažnyčia.1832 m. po numalšinto sukilimo rusai Pašaltuonio bažnyčią ir vienuolyną uždarė, turtus nusavino. Tik vyskupo Motiejaus Valančiaus dėka 1858 m. bažnyčia buvo atnaujinta ir vėl pradėjo veikti. 1890 m. kunigo Vrubliausko dėka Pašaltuonyje pastatyta nauja bažnyčia tituluota „Švč. Mergelės Marijos ėmimo į dangų“ titulu. Pietrytiniame šventoriaus kampe pastatyta nauja varpinė.
Istorizmo stiliaus Pašaltuonio bažnyčia pastatyta ant tinkuoto akmens ir plytų mūro cokolio ant kurio yra įamžinta bažnyčios statybos data – 1889 m. Bažnyčia stačiakampio plano su keturkampe už navą siauresne presbiterija. Todėl abipus presbiterijos yra įdubos, kurias dengia vienšlaičiai stogeliai. Presbiterija užbaigiama trisiene apside su trikampiu stogeliu. Pagrindinis skardos lakštais dengtas bažnyčios stogas – dvišlaitis. Virš pagrindinio fasado frontono – barokinės raiškos aštuonkampis bokštelis su kryžiumi. Panašus, tik mažesnis, bokštelis puošia apsidę. Sienos apkaltos vertikaliai su lentjuostėmis, pastogę bei cokolį juosia profiliuoti karnizai. Bažnyčios langai – gotikai būdingos smailėjančios arkos formos. Pagrindinis fasadas be dekoro su aukštu trikampiu frontonu, kurio centre įkomponuotas arkinis langas. Frontoną nuo fasado skiria nedidelis stoginėlis. Virš plačių dvivėrių durų pritaisytas dvišlaitis stogelis.
Bažnyčios vidus – vienos navos su prienaviu, nuo pagrindinės erdvės atskirtu siena. Prie jos iš abiejų pusių pritvirtintos giedotojų ložės. Interjere vyrauja neogotika ir neobarokas. Puošnūs suolai-klauptai papuošti smailėjančių arkų dekoru. Gotikai taip pat būdinga smailėjančios arkos su masverkų imitacija panaudota klausyklų dizaine. Didysis medinis Švč. Mergelės Marijos Ėmimo į dangų altorius su to paties vardo pagrindiniu paveikslu pasižymi saikinga neobarokine plastika.
Pašaltuonio bažnyčios varpinė kvadratinio plano, įsiterpusi į šventoriaus tvorą. Varpinė dviejų tarpsnių, apatinis daug platesnis už viršutinį. Stogas keturšlaitis su smaile ir kryžiumi. Varpinė apkalta vertikaliai su lentjuostėmis. Antrajame tarpsnyje – stačiakampės akustinės angos. Du varpai parapijiečių lėšomis įsigyti 1931 m.
Šventorių juosia akmens mūro tvora su plačiais mūriniais vartais. Arkiniai vartai su trikampiu frontonu, kurio centre įstiklinta niša su mediniu Aušros vartų Švč. Mergelė Marijos reljefu ir graikiškais kryžiais abipus nišos.
Šventoriuje taip pat yra kapinės. Čia palaidotas Kęstučio apygardos partizanų ryšininkas Antanas Brazas bei ilgametis Pašaltuonio bažnyčios vargonininkas ir chorvedys Izidorius Sabonas.
Pašaltuonio bažnyčia ir varpinė - Pašaltuonio Švč. Mergelės Marijos Ėmimo į dangų bažnyčia
