Marcinkonyse pirmoji bažnyčia iškilo dar 1770 m., o dabartinė pastatyta 1880 m. Čia spaudos draudimo laikotarpiu buvo aktyviai priešinamasi carinės Rusijos represijoms: Marcinkonyse gyvenęs ir pamaldas laikęs klebonas Jonas Šoblickas puoselėjo lietuvybę, laikė pamaldas lietuvių kalba, platino lietuvišką spaudą. 2018 metais bažnyčia, varpinė ir šventoriaus tvoros koplytėlės atnaujintos parapijiečių suaukotomis lėšomis ir dovanotomis medžiagomis.
Pats pastatas medinis, turintis sakralinės liaudies architektūros, neogotikinių ir neobarokinių bruožų. Dvibokštės bažnyčios siluetas artimas mūrinėms barokinio stiliaus bažnyčioms, kur pagrindinis fasadas yra įrėmintas dviem simetriškais bokštais, o vertikaliomis lentomis su siauresnėmis lentjuostėmis apkaltas sienas puošia gotikai būdingi smailėjančių arkų langai. Stogas dvišlaitis, dengtas skarda, virš pagrindinio fasado frontono ir virš presbiterijos iškilę bokšteliai. Virš presbiterijos esantis puošnus barokinių formų bokštelis – šešiakampis. Jo abu tarpsniai su mažais arkiniais langeliais, dengti šešiakampiais šalmais. Pagrindinio fasado bokštai – keturkampio pagrindo, šoniniai – dviejų tarpsnių, iš kurių kiekvienas užsibaigia 4 frontonėliais ir daugiašlaičiais stogeliais. Antrojo tarpsnio formos atsikartoja mažesniajame virš frontono esančiame bokštelyje. Visus bokštus puošia ornamentuoti kaltiniai kryžiai. Pagrindiniame fasade esantį įėjimą puošia gotikai būdingų masverkų imitacijos, frontone – suporintų arkinių langų imitacijos, frontono viršus puoštas profiliuotomis vėjalentėmis.
Interjeras įrengtas liaudiško baroko stiliumi, jame gausu reikšmingų meno vertybių. Tarp jų – autentiški XVIII a. pradžios Šv. Roko ir Šv. Barboros paveikslai. Didžiajame altoriuje įkomponuota Jėzaus Nazariečio skulptūra, kuri atitinkamomis progomis uždengiama Rožinio Švč. Mergelės Marijos paveikslu. Antrame altoriaus tarpsnyje – titulinis Šv. Apaštalų Simono ir Judo Tado paveikslas. Pirmą ir antra didžiojo altoriaus tarpsnius jungia originalios augalinės ornamentikos voliutos.
Šventoriuje stovi itin reto tipo Lietuvoje dviejų kryžmų kryžius, pastatytas 1933 m. Mūrinėje šventoriaus tvoroje yra 14 Kryžiaus kelio stočių koplytėlių. Taip pat į tvorą įkomponuota medinė keturkampio pagrindo dviejų tarpsnių liaudiškos architektūros varpinė, kurios siluetas labai būdingas lietuviškų bažnytkaimių varpinėms.
Marcinkonių bažnyčia - Miškininkų g. 118, Marcinkonys, Varėnos r.
