История костела в Алёнис берет свое начало в XVIII в., когда на местном кладбище была возведена частная часовня помещиков Ясенских, в которой разрешалось совершать богослужения. Приход здесь был основан только в межвоенный период, а благодаря настоятелю прихода Йонасу Венажиндису вместо старой деревянной часовни в 1932 г. вырос современный костел, спроектированный инженером-архитектором Йонасом Боровскисом. С исторической точки зрения уникальность Алёнского прихода в Литве заключается в том, что его появление было вызвано агрессией Польши в отношении Литвы в 1920 г. Граница Алёнского прихода совпадает с бывшей демаркационной (административной) линией, отделявшей независимую Литву от оккупированного поляками Вильнюсского края.
Деревянный костел прямоугольного плана, с пятистенной апсидой ниже нефа. С обеих ее сторон находятся низкие сакристии. На главном фасаде – невысокая массивная трехъярусная башня на четырехугольном основании. Каждый ярус башни заканчивается козырьком, который в свою очередь горизонтально делит на 2 части плоскости других фасадов костела. Башня заканчивается двухступенчатой крышей. Конек крыши над пресвитерией украшен декоративной восьмигранной двухъярусной башенкой с 4 оконцами арочной формы. Обе башни увенчаны орнаментальными крестами конца XIX в. – начала XX в. Окна боковых фасадов большие, прямоугольной формы, в пресвитерии и сакристии – окна поменьше квадратной формы и в форме полукруглых арок. На вернем яруса башни – горизонтально обшитые звуковые отверстия в форме арок, на третьем – слуховые оконца в форме ромба.
Костел в народном стиле, ему присущи исключительные, характерные для народной архитектуры черты, особенно подчеркнутые на его фасадах. При возведении данного здания уникальным способом использовалась традиционная строительная техника: стены здания, кроме фронтонов и верхних ярусов башни, возведены из тесаного бруса, не обшитого досками. Фронтоны и верхние ярусы башни обшиты вертикальными досками. При декорировании святилища оригинально использованы обычные конструкционные элементы – связка деревянных бревен . Выступающие на главном фасаде здания углы сруба удлиняются книзу, своей формой напоминая контрфорсы, характерные для профессиональной готической архитектуры кирпичных костелов . Декоративность апсиде придает вертикальное деление ее плоскости и отчетливые соединения деревянных бревен с оставленными более длинными выступами.
Информация